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8000种肿瘤样本!全球首份癌症病例图谱发布

近日,《科学》杂志刊登了瑞典科学家的重要成果——全球首份癌症病例图谱“Atlas”,该图谱将数千种特定癌症相关基因与患者生存情况联系起来,发掘出32种不以癌症类型分类、但与80%人类癌症相关的“公共”基因,可作为潜在新药研发的精准靶点。

同时,这一成果将有助于医生对未来癌症治疗的预测:通过现有的数据,基因组范围内的个人代谢模型得以建立,研究人员可以借此预测肿瘤的发展,并提出有针对性的治疗方案,改善患者预后,延长患者的生存时间。因此,该图谱被认为是肿瘤临床实践革命性改进的重要推手,据悉,Atlas图谱数据免费向公众开放(www.proteinatlas.org/pathology ),共享将为其他研究者提供更多参考数据。

另悉,Atlas项目的领导者是来自瑞典皇家理工学院教授马瑟尔斯·阿合雷,同时任职欧洲生物技术联合会主席,其带领科研团队使用超级计算机,分析了8000种肿瘤样本中的17种主要类型的人类癌症,并使用RNA测序方法,了解基因在受癌症影响时发生的变化,积极寻求”基因突变导致的基因组整体变化。

研究人员确定了2000多个抑制肿瘤生长的基因,但绝大多数基因靶向药物会同步产生强烈的副作用。经筛选,发现其中32种基因存在于超过80%的肿瘤样本中,且与癌症具体类型无关,它们可以作为新药研发的靶子。

此外,依据肿瘤类型和肿瘤位置,研究人员还发现,超过2000种基因对病人生存率等“预后”有着不同的影响,他们还进一步将这些“预后”基因分为“有利于预后”和“不利于预后”两类,而以往对”预后“基因的研究屈指可数。

马瑟尔斯·阿合雷表示:试验结果表明,大部分癌症蛋白质编码基因的表达是有差异的,并且在许多情况下,对患者的存活率产生了很大影响,据系统生物学分析显示,特定癌症中个体肿瘤的基因表达差异很大,可能超过不同癌症类型之间观察到的变化,然而临床结局所需的一般预后基因不适用于所有癌症,而Atlas图谱中的数据使我们能够为癌症患者生成个性化的基因组代谢模型,以确定参与肿瘤生长的关键基因。此外,我们还探索了与肿瘤细胞去分化相关的组织特异性基因,以及特定癌症抗原在全基因组范围内的作用。

大部分学者对Atlas图谱都做出了较高的评价,认为该图谱可以推动临床 精准医疗 ,特别是其中基因部分的知识,对于特效药物和广谱药物的研发都至关重要;另外,该图谱还可以让医生尝试性针对病人的临床数据,做出用药或手术的精准干预方案,而关于生存期的知识则可以让医生对不同患者给出个体化生活方式的指导。

然而,个别学者对图谱持审慎态度,认为该图谱并不能给医生一个明确的答案。

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